Учёные сделали важное открытие для понимания того, как вирус иммунодефицита человека проникает в ядро клетки, позволяя ей размножаться и распространяться. Для этого они провели компьютерное моделирование с участием тысяч белков, в котором рассматривались капсид ВИЧ (капсула, содержащая материал вируса) и комплекс ядерной поры клетки — почтовый ящик, через который отправляется и доставляется генетическая информация.
«Поровый комплекс — это невероятный механизм», — говорит химик-теоретик Грегори Вот из Чикагского университета. «Он не может пропустить в ядро клетки все, что угодно, иначе у вас будут серьёзные проблемы, но он должен пропускать довольно много всего. Капсид ВИЧ каким-то образом придумал, как пробраться внутрь. Проблема в том, что мы не можем наблюдать за этим вживую: чтобы получить хотя бы один моментальный снимок, нужно приложить невероятные экспериментальные усилия».
Моделирование показало, что капсид ВИЧ вклинивается в клетку сначала узким концом, а затем с помощью так называемого электростатического храповика. Исследователи сравнивают его с ремнём безопасности в автомобиле, который затягивается всё туже и туже.
Другой ключевой вывод: гибкость и деформация как капсида, так и поры играют решающую роль в прохождении капсида. Для того, чтобы выдержать дополнительное давление, капсид формирует области из менее упорядоченных молекул, и исследователи считают, что именно этим можно объяснить его конусообразную форму.
Ранее исследователи не были уверены в том, что капсид остаётся полностью целым, когда он протискивается через комплекс пор. Более глубокое понимание происходящего поможет в изучении клеточных взаимодействий.
«Я думаю, что это моделирование также даёт нам новый способ понять, как многие вещи попадают в ядро, а не только ВИЧ», — сказал Вот.
